Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms