Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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