Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2AQ12879 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
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