Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms