Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms