Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
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