Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms