Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms