Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms