Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms