Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APBA1Q02410 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms