Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms