Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms