Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP1Q00587 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms