Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TFAMQ00059 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms