Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 FHDC1-201ENST00000260008 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 NPC1L1-204ENST00000546276 4826 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 CCAR2-206ENST00000520861 3560 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 DCAF4-213ENST00000555042 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 FCRLA-206ENST00000367949 1792 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 PIK3C2B-204ENST00000424712 7522 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 CAMK2B-209ENST00000395749 4447 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 TBC1D29-202ENST00000580161 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 ADPRH-201ENST00000357003 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 SLC44A4-210ENST00000544672 2634 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 BLZF1-201ENST00000329281 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 NLRP1-201ENST00000262467 5131 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 MTUS2-206ENST00000612955 7430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 ZEB2-236ENST00000636471 9583 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 C14orf119-201ENST00000319074 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 ARHGEF10L-203ENST00000375408 3685 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 ULK4-201ENST00000301831 4613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 GLT8D2-201ENST00000360814 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 DRC7-202ENST00000360716 3041 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 CADM2-201ENST00000383699 9488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 DTL-201ENST00000366991 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 EPPK1-201ENST00000568225 15530 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
TMEM258P61165 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms