Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB15P59190 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB15P59190 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 433.2 ms