Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCKAP1LP55160 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCKAP1LP55160 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCKAP1LP55160 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCKAP1LP55160 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCKAP1LP55160 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCKAP1LP55160 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCKAP1LP55160 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms