Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA4P54764 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA4P54764 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA4P54764 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA4P54764 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA4P54764 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA4P54764 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA4P54764 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA4P54764 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EPHA4P54764 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA4P54764 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EPHA4P54764 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA4P54764 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA4P54764 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA4P54764 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA4P54764 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA4P54764 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA4P54764 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA4P54764 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA4P54764 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPHA4P54764 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EPHA4P54764 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EPHA4P54764 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPHA4P54764 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EPHA4P54764 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPHA4P54764 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EPHA4P54764 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EPHA4P54764 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPHA4P54764 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPHA4P54764 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.05■□□□□ 0
EPHA4P54764 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPHA4P54764 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPHA4P54764 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms