Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC5A3P53794 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms