Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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PGGT1BP53609 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PGGT1BP53609 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PGGT1BP53609 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PGGT1BP53609 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PGGT1BP53609 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PGGT1BP53609 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PGGT1BP53609 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PGGT1BP53609 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PGGT1BP53609 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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