Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NESP48681 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NESP48681 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NESP48681 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NESP48681 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NESP48681 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NESP48681 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NESP48681 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NESP48681 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NESP48681 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NESP48681 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NESP48681 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NESP48681 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NESP48681 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NESP48681 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NESP48681 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NESP48681 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NESP48681 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NESP48681 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NESP48681 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NESP48681 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NESP48681 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NESP48681 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NESP48681 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NESP48681 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NESP48681 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NESP48681 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NESP48681 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NESP48681 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NESP48681 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NESP48681 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NESP48681 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
NESP48681 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NESP48681 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
NESP48681 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NESP48681 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
NESP48681 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
NESP48681 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NESP48681 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NESP48681 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NESP48681 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NESP48681 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NESP48681 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NESP48681 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NESP48681 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NESP48681 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NESP48681 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NESP48681 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NESP48681 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NESP48681 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NESP48681 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NESP48681 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NESP48681 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NESP48681 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NESP48681 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NESP48681 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NESP48681 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NESP48681 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NESP48681 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NESP48681 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NESP48681 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NESP48681 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NESP48681 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NESP48681 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NESP48681 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NESP48681 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NESP48681 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NESP48681 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NESP48681 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NESP48681 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NESP48681 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NESP48681 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NESP48681 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NESP48681 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NESP48681 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NESP48681 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NESP48681 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NESP48681 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NESP48681 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NESP48681 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NESP48681 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NESP48681 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NESP48681 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NESP48681 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NESP48681 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NESP48681 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NESP48681 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NESP48681 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NESP48681 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NESP48681 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NESP48681 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NESP48681 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NESP48681 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NESP48681 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NESP48681 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NESP48681 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NESP48681 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NESP48681 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NESP48681 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NESP48681 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms