Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms