Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF5P43026 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF5P43026 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDF5P43026 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDF5P43026 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDF5P43026 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDF5P43026 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDF5P43026 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDF5P43026 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDF5P43026 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDF5P43026 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDF5P43026 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDF5P43026 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDF5P43026 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDF5P43026 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDF5P43026 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDF5P43026 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDF5P43026 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDF5P43026 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDF5P43026 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDF5P43026 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDF5P43026 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDF5P43026 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDF5P43026 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDF5P43026 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDF5P43026 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDF5P43026 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDF5P43026 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDF5P43026 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDF5P43026 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDF5P43026 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDF5P43026 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDF5P43026 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDF5P43026 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDF5P43026 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDF5P43026 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDF5P43026 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms