Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms