Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPOP42166 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPOP42166 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPOP42166 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPOP42166 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPOP42166 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPOP42166 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPOP42166 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPOP42166 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPOP42166 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPOP42166 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPOP42166 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPOP42166 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPOP42166 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPOP42166 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPOP42166 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMPOP42166 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMPOP42166 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMPOP42166 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMPOP42166 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMPOP42166 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMPOP42166 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMPOP42166 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMPOP42166 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMPOP42166 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMPOP42166 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMPOP42166 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMPOP42166 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPOP42166 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPOP42166 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms