Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCNCP24863 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCNCP24863 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CCNCP24863 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCNCP24863 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCNCP24863 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCNCP24863 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCNCP24863 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCNCP24863 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCNCP24863 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCNCP24863 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNCP24863 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNCP24863 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNCP24863 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNCP24863 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNCP24863 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNCP24863 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNCP24863 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNCP24863 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNCP24863 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNCP24863 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNCP24863 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNCP24863 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNCP24863 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNCP24863 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNCP24863 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNCP24863 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNCP24863 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNCP24863 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNCP24863 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNCP24863 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNCP24863 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNCP24863 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNCP24863 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNCP24863 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNCP24863 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNCP24863 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNCP24863 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNCP24863 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNCP24863 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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