Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms