Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGA6P23229 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms