Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRHP20396 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRHP20396 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRHP20396 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRHP20396 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRHP20396 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRHP20396 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRHP20396 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRHP20396 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRHP20396 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRHP20396 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRHP20396 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRHP20396 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TRHP20396 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRHP20396 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRHP20396 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRHP20396 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRHP20396 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRHP20396 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRHP20396 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRHP20396 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRHP20396 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRHP20396 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRHP20396 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRHP20396 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRHP20396 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRHP20396 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRHP20396 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRHP20396 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRHP20396 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRHP20396 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRHP20396 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRHP20396 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRHP20396 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRHP20396 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRHP20396 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRHP20396 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRHP20396 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRHP20396 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRHP20396 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRHP20396 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRHP20396 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRHP20396 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRHP20396 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRHP20396 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRHP20396 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRHP20396 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRHP20396 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRHP20396 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRHP20396 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRHP20396 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRHP20396 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRHP20396 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRHP20396 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRHP20396 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRHP20396 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRHP20396 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRHP20396 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRHP20396 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRHP20396 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRHP20396 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRHP20396 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRHP20396 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRHP20396 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRHP20396 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRHP20396 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRHP20396 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
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