Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFE3P19532 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFE3P19532 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFE3P19532 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFE3P19532 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFE3P19532 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFE3P19532 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFE3P19532 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFE3P19532 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFE3P19532 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFE3P19532 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFE3P19532 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFE3P19532 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFE3P19532 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFE3P19532 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFE3P19532 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFE3P19532 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms