Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms