Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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PKHD1P08F94 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
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PKHD1P08F94 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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PKHD1P08F94 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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PKHD1P08F94 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
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PKHD1P08F94 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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PKHD1P08F94 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
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PKHD1P08F94 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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