Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJB1P08034 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJB1P08034 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB1P08034 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB1P08034 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB1P08034 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB1P08034 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB1P08034 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB1P08034 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB1P08034 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB1P08034 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB1P08034 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB1P08034 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB1P08034 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB1P08034 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB1P08034 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB1P08034 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB1P08034 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB1P08034 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB1P08034 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB1P08034 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB1P08034 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB1P08034 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB1P08034 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB1P08034 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB1P08034 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB1P08034 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB1P08034 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB1P08034 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJB1P08034 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJB1P08034 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB1P08034 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB1P08034 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB1P08034 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB1P08034 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB1P08034 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB1P08034 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB1P08034 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB1P08034 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB1P08034 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB1P08034 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB1P08034 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB1P08034 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB1P08034 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB1P08034 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB1P08034 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB1P08034 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB1P08034 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB1P08034 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB1P08034 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB1P08034 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB1P08034 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB1P08034 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB1P08034 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJB1P08034 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms