Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTMAP06454 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTMAP06454 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTMAP06454 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTMAP06454 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTMAP06454 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTMAP06454 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTMAP06454 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTMAP06454 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTMAP06454 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTMAP06454 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTMAP06454 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTMAP06454 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTMAP06454 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTMAP06454 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTMAP06454 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTMAP06454 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTMAP06454 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTMAP06454 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTMAP06454 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTMAP06454 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTMAP06454 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTMAP06454 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTMAP06454 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms