Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms