Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX3O95343 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX3O95343 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms