Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP2O95045 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP2O95045 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP2O95045 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP2O95045 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP2O95045 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP2O95045 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP2O95045 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP2O95045 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP2O95045 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP2O95045 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP2O95045 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP2O95045 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP2O95045 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP2O95045 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP2O95045 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP2O95045 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP2O95045 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP2O95045 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP2O95045 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.7 ms