Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COCHO43405 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COCHO43405 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COCHO43405 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COCHO43405 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COCHO43405 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COCHO43405 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COCHO43405 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COCHO43405 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms