Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM6BO15054 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM6BO15054 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM6BO15054 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM6BO15054 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM6BO15054 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM6BO15054 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6BO15054 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms