Protein–RNA interactions for Protein: O00634

NTN3, Netrin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN3O00634 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTN3O00634 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NTN3O00634 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTN3O00634 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTN3O00634 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTN3O00634 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTN3O00634 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTN3O00634 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTN3O00634 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTN3O00634 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTN3O00634 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTN3O00634 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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