Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM5B3KS81 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM5B3KS81 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM5B3KS81 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM5B3KS81 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM5B3KS81 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM5B3KS81 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM5B3KS81 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM5B3KS81 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM5B3KS81 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM5B3KS81 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM5B3KS81 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM5B3KS81 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM5B3KS81 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM5B3KS81 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM5B3KS81 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM5B3KS81 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM5B3KS81 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM5B3KS81 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM5B3KS81 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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