Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms