Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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