Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.4 ms