Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM247A6NEH6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms