Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms