Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXND1Q9Y4D7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms