Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms