Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms